Попробуйте увеличить время (период) опроса модуля Модбас мастер .Похожая проблемма была на "старых" МДВВ (до 2010г), но там периодически подрабатывал 1 выход .Причем (не помню точно) или на РТУ или Аски.
Присвоение значения переменной маски выходов поставьте в конце цикла программы.