сделайте кнопки "включить" + "выключить", идея как на компах. при нажатии на кнопку "включить" подаем напругу на обмотку пускателя, который сработав, блокирует кнопку "включить". все заработало....
при нажатии на кнопку "выключить" ( подключенную к входу) контроллер аккуратно сохранит свои переменные в файлик, после чего включит релюшку (с нормально замкнутыми контактами) и разблокирует пускатель и соответственно весь стенд выключиться....
есть еще одна идея, менять аккумулятор на ионистор. в этом случае заряд, необходимый для корректного выключения мы получаем за секунду работы контроллера, да и деградация практически не происходит.... ну время работы после пропадания питания будет меньше, а нужно оно большое??