Спасибо CEkip за помощь.
Понимание о прочитанном и увиденном:
При записи имени переменной в конфигурации ПЛК она прописывается как глобальная переменная. (эти имена резервируются за физическим входом/выходом). В поле глобальных переменных их дублировать (записывать) не надо,(ошибка). Если при написании имени объекта в программе всплывет окно (определения переменной) и ничего не меняя подтвердить ОК - переменная пропишется как локальная и в дальнейшем если она совпадет при написании имени физического входа/выхода в конфигурации ПЛК локальная переменная не даст работать физическому адресу, что и произошло. При этом ошибка при совпадении имен не указывается. Проста локальная переменная имеет приоритет исполнения перед глобальной при совпадении имен. Для себя сделал вывод - нужно в программе физический вход/выходы записывать его физическим адресом (%QX1.1).