Это и является ключевой проблемой. Как упомянуто в руководстве, экспорт проектов поддержан только из версий Конфигуратора СП200 не младше 2.с.6f.
К сожалению, в данном случае вам придется создавать проект заново.
А если, я в процессе создания нового проекта скопирую изображения, двигатели, кнопки со старого и вставлю в новый, не повторится ли у меня проблема с исторической таблицей?