Вы совершенно правы. Именно так он и был запрограмирован перед испытаниями, но здесь важную роль играет параметр tc постоянная времени входного фильтра. По описанию прибора она должна быть 0,5 (1000 гц = 1 мс, нижний активный уровень сигнала = 0,5 мс). На деле пришлось подбирать эту величину и прибор начал устойчиво показывать разницу частот при tc=0,1.
Приятный сюрприз от СИ-8, он умеет вычитать частоты!