А вы калибровку проводили с теми проводами, которыми подключены датчики или нет?
Если без, то понятно почему. У ПТ1000 гораздо меньшее влияние на показания имеет длина провода, сопротивление 2-10 Ом. Для 50М даже погрешность в измерении сопротивления провода 0,1 Ом уже приведёт к погрешности 0,5 градуса. Для ПТ1000 - 0,02 градуса.