Отобразить название устройства

[SCADAMaster]

Перетащил. Но если в левой части не убрал птичку с данного ресурса - он все равно меняется.

Вы сперва ставите галочки а потом применяете фильтр - тогда да, может применится.
Нужно сперва включить фильтр, а уже затем отмечать нужные вам компоненты.

Задал для объекта окно управления. В шаблоне меняю свойства этого окна, но на экземпляры эти изменения не проходят.

Эта ошибка. Она уже исправлена - обновитесь до 3.7

И еще один вопрос - как задать открытие окна относительно координат клика мышью?

Это обязательное требование?
Сделать так конечно можно - нужно использовать ФБ "Управление документом", у него есть настройка "Использовать значения входов при открытии документа" - тогда используя входы группы "Открыть" можно открыть окно с нужными координатами.
Пример в приложении.
Хотим обратить внимание, что такая кнопка открытия работает только на том компьютере на котором объект исполняется. Т.е. в сетевом проекте на компьютере-клиенте данное окно не откроется (или у этого объекта назначать исполнение "Выполнять на всех").