Так же получаю ~10% пропуска импульсов.
Что сделано:
1. Прочитан пост 16 и по руководству добавлен счетчик на вход
2. Подсчет импульсов на входе находится в конце программы

Нашел методику проверки выхода от Гранд, на 200 импульсов допустимо -\+ 1 импульс.