1. подключиться без загрузки проекта
2. создать загрузочный проект
3. перезагрузить плк командой через браузер
4. подключиться еще раз, там уже будет работать актуальный проект

... но опрос на время перезагрузки конечно остановиться и переменные будут инициализированы