Кажется, я понял, в чём дело. Там есть и регулирующее реле температуры, выключающее горелку, и аварийное?
Наверное, изготовитель котла поместил контакты регулирующего реле температуры, выключающего горелку, в цепь электропитания "топочного автомата":
Honeywell DKG-972.gif
...А по логике, это реле должно размыкать только электропитание газовых клапанов.