Конфигурирование ModBus Master TCP так и останется c использованием одного из последовательных портов.
http://www.owen.ru/forum/showthread.php?t=22078 - эта проблема была у Вас на прошивке 2.14.0 или на 2.15.3?
В версии прошивки 2.15.3 вносились изменения в работу конфигурационных узлов ModBus TCP Master/Slave.