Отвечу на свой вопрос. Действительно на работу аналоговых входов и выходов влияет какой режим работы установлен у аналоговых выходов. Перестал выключаться ПЛК, аналоговые входы и выходы не зависают и масштабирование MinFV и MaxFV стало работать как надо. Получается, что для прибора с модификацией .И-М необходимо на все выходы устанавливать режим работы 4..20мА.
Думаю такие вещи лучше прописывать в руководстве.